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Genome-wide analysis of the malaria parasite Plasmodium falciparum isolates from Togo ...

时间:2020-12-30 12:36 点击数:415 作者:寄生虫病所    

    疟疾在多哥也是重要的公共卫生问题,因此,提供有效消除疟疾的生物学方法是研究的优先选项。一般而言,疟原虫的遗传选择是由宿主免疫等多种因素共同作用的结果。我们对来自多哥的10个恶性疟原虫(Pf)临床分离株进行全基因组测序和变异分析,以确定特异性选择信号。测序结果均覆盖超过95%的Pf参考基因组3D7序列,以及获得266963个单核苷酸多态性数据,平均核苷酸多样性π=1.79×10−3。主成分和进化树分析表明,多哥恶性疟原虫的聚集与非洲起源有关。此外,多哥Pf的平均全基因组多样性远高于其他非洲样本。Tajima’s D值为-0.56,这表明了定向选择和/或最近种群扩张的证据。在此背景下,群体遗传分析确定平衡位点和最近的阳性选择证明宿主免疫是主要的选择因子。特别是与入侵红细胞相关的裂殖子表面抗原、膜抗原。这与预期一致,即由于等位基因特异性获得性免疫而引起的选择信号升高可能会作用于抗原靶点。总的来说,多哥的Pf群体最近在扩大,并且证明在平衡/阳性选择重要基因位点的信号中反映出对膜/表面抗原的强烈宿主免疫选择。这项研究的结果为多哥开展有效疟疾控制研究提供了基础。

    本文的第一和并列通讯作者是江南大学无锡医学院Kokouvi Kassegne博士,中国疾控中心寄生虫病陈军虎研究员和江南大学无锡医学院程洋副教授为并列通讯作者。该文发表于Front Immunol. 2020;11:552698。






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