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单分子磁镊技术采用DNA平行力路设计研究MLL1蛋白结构域PHD3-Bromo与H3K4me3的相互作用

时间:2020-02-18 14:09 点击数:462 作者:寄生虫病所    

单分子力谱技术是用来直接测量蛋白相互作用(PPI)的一种功能强大的方法。对PPI进行高特异性和高精度的单分子测量,可以揭示分子间互作的详尽机制。本研究工作中,我们提出一种DNA平行力路的策略,在单分子磁镊平台上进行PPI检测。携带负电荷的DNA作为PPI的连接分子,规避了蛋白作为连接分子带来的蛋白聚集问题。待测蛋白中引入非天然氨基酸,大大扩展了生物正交耦合的基团选择。我们展示了如何应用这一策略检测PHD3-Bromo结构域与H3K4me3的相互作用。我们发现破坏这一PPI需要12 pN,比把DNA从核小体上撕下来的力(3 pN)要高得多。我们预期我们的方法将使得PPI的生物力学和动力学测量更加精确,并促进我们联合团队在疟疾等其它疾病PPI的研究发现。

本文第一作者是南开大学马小凤博士,中国疾病预防控制中心寄生病预防控制所陈军虎研究员、吉林大学张文科教授和南开大学于仲波教授为本文的并列通讯作者。该文发表在Bioconjug Chem., 2019, 30, 12, 2998-3006.

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