首次解析细粒棘球绦虫原头节源和囊液源外泌体样囊泡非编码RNA表达谱

囊型包虫病是一种慢性人畜共患病，呈全球性分布，严重威胁人类健康和畜牧业发展。寄生虫可通过释放外泌体样囊泡（ELVs）参与寄生虫-宿主的相互作用，寄生虫源ELVs可以将非编码RNA转移到宿主细胞中，以调节其基因的表达。在国家自然科学基金的支持下，本研究对获得的细粒棘球绦虫原头节（protoscoleces，PSCs）培养液和绵羊可育囊囊液（hydatid fluid，HF）ELVs，采用透射电子显微镜、纳米粒子跟踪分析和Western blotting进行鉴定，结果其大小，形态与外泌体一致，且含有特定的外泌体标记物。随后，利用高通量测序分析了这两种ELVs的ncRNAs（包括miRNAs、lncRNAs和circRNAs）表达谱，并利用GO和KEGG对PSC-ELVs中含量前20的miRNAs功能进行预测。在PSC-ELVs和HF-ELVs中，分别鉴定出118和58个miRNAs，两者共表达的miRNAs共有53个，其中PSC-ELVs特异表达65个，HF-ELVs特异表达5个。在PSC-ELVs和HF-ELVs分别鉴定出2361和1254个lncRNAs，其中两者共表达的lncRNAs共有1004个，PSC-ELVs特异表达1357个，HF-ELVs特异表达250个。应用荧光定量PCR检测，对部分miRNAs进行验证，与测序结果一致。此外，从PSC-ELVs含量前20的miRNAs中筛选出与宿主免疫应答有关的miRNAs，及其调控的lncRNAs和mRNAs，并构建了一个包含5个miRNAs，41个lncRNAs和23个mRNAs的ceRNA调控网络。PSC-ELVs含量前20的miRNAs的靶基因可能参与调控寄生虫感染过程中的炎症反应、MAPK级联反应和胶原分解代谢过程。本研究为首次鉴定获得PSC-ELVs和HF-ELVs的ncRNAs谱，丰富了细粒棘球绦虫的ncRNAs数据，筛选获得1批可能与宿主免疫应答和发病机制有关的ncRNAs。这些结果为进一步研究细粒棘球绦虫源外泌体中的ncRNAs（尤其是miRNAs）在寄生虫-宿主相互作用中发挥的免疫调控功能提供理论基础和新思路。

该文第一作者是中国疾病预防控制中心硕士研究生张小凡，通讯作者为沈玉娟研究员和曹建平研究员。该文于2020年7月22日发表在《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》。

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