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RNA-seq analysis of differentially expressed LncRNAs from leishmaniasis patients compared to uninfected humans

时间:2023-01-13 21:04 点击数:668 作者:寄生虫病所    

利什曼病是一种严重危害人类健康的寄生虫病。此外,在寄生虫病中,利什曼病是仅次于疟疾和血吸虫病的第三大常见死亡原因。然而,lncRNA在利什曼病中的潜在功能尚不清楚。本研究旨在探讨利什曼病中差异表达的lncRNA。结果显示,与对照组相比,筛选出970个差异表达的lncRNA1692个差异表达的mRNA。利用生物信息分析和ENCORI数据库鉴定出520个目的基因。生物信息学分析显示,差异表达的靶基因富集于自噬动物、FoxO信号通路、mTOR信号通路和凋亡等。在差异表达的lncrna中,筛选出9个关键lncRNA (MALAT1NUTM2A-AS1LINC00963高表达;LINC00622MAPKAPK5-AS1LINC02289XPC-AS1ZFAS1SNHG5低表达)。本研究提示lncrna的不同表达可能参与了利什曼病的潜在功能,为这种人畜共患疾病的诊断提供了新的思路利什曼病是一种严重危害人类健康的寄生虫病。此外,在寄生虫病中,利什曼病是仅次于疟疾和血吸虫病的第三大常见死亡原因。然而,lncRNA在利什曼病中的潜在功能尚不清楚。本研究旨在探讨利什曼病中差异表达的lncRNA。结果显示,与对照组相比,筛选出970个差异表达的lncRNA1692个差异表达的mRNA。利用生物信息分析和ENCORI数据库鉴定出520个目的基因。生物信息学分析显示,差异表达的靶基因富集于自噬动物、FoxO信号通路、mTOR信号通路和凋亡等。在差异表达的lncrna中,筛选出9个关键lncRNA (MALAT1NUTM2A-AS1LINC00963高表达;LINC00622MAPKAPK5-AS1LINC02289XPC-AS1ZFAS1SNHG5低表达)。本研究提示lncrna的不同表达可能参与了利什曼病的潜在功能,为这种人畜共患疾病的诊断提供了新的思路。

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