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Analysis of gene expression profile of peripheral blood in alveolar and cystic echinococcosis

时间:2022-12-01 13:10 点击数:559 作者:寄生虫病所    

棘球蚴病(包虫病)是全球地理分布最广的人畜共患寄生虫病之一,人因摄入棘球绦虫的虫卵而感染,逐渐形成占位性病变。包虫病在我国流行范围广、流行程度高、疾病负担重,是重大公共卫生问题之一。包虫病的诊断和治疗还存在瓶颈,影像学检查在感染早期不够敏感,免疫学检测特异性不足,手术治疗可能复发,药物治疗有一定副作用等,这些瓶颈制约着包虫病的防治效果。本研究,采集到6名泡型包虫病患者、6名囊型包虫病患者以及6名健康者(对照组)的外周血,进行了高通量RNA测序(RNA-seq)以评估其基因转录和表达水平,并对测序数据进行生物信息学分析。结果表明,与健康对照组相比,泡型包虫病组发现492个差异表达基因(DEGs),其中270个上调,222个下调;囊型包虫病组发现424DEGs,其中170个上调,254个下调。生物信息学基因富集分析发现这些DEGs主要参与分子功能,包括细胞外空间、细胞外区域、器官和系统发育以及结构发育,与包虫病的发病相关。蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析表明差异显著的DEGs可作为潜在的诊断棘球蚴病生物标志物。本研究为突破棘球蚴病诊疗中的瓶颈提供了新的思路和线索,也为更大样本量进一步开展包虫病生物学和功能研究打下了基础。

本论文第一作者为刘磊博士后,曹建平研究员和王莹副研究员为共同通讯作者,论文2022811日发表于《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》。

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